С учетом отсутствия серьезного прогресса в рамках посреднических усилий Саудовской Аравии и США по организации эффективного переговорного процесса между противоборствующими суданскими силами, основной центр усилий со стороны Африканского союза (АС) сейчас сосредоточен на гуманитарном аспекте этого кризиса.   В настоящее время невозможно вылететь в столицу Судана из-за боевых действий, и АС находится в процессе принятия решения о том, как наилучшим образом обеспечить безопасность, чтобы гуманитарные работники, а также африканские и западные гуманитарные группы могли начать свою работу на местах. В рамках  АС начались обсуждения между Эфиопией и Бурунди, одна из которых вскоре, как предполагается, может разместить своих военных вокруг аэропорта Хартума для обеспечения безопасности объекта и его окрестностей и обеспечения доставки гуманитарной помощи. Окончательное решение по поводу всех аспектов этой опасной операции примут 15 членов Комитета по вопросам мира и безопасности Африканского союза (PSC). Также к этой операции могут быть привлечены другие африканские армии с учетом того, что предлагаемому участию Эфиопии по обеспечению безопасности аэропорта Хартума могут помешать тесные отношения между эфиопским премьером Абием Ахмедом и командующим Силами быстрой подержки (RSF) Мухаммедом Хамданом Дагло (Хемити) до нынешних столкновений. Следовательно, командующий суданской армией Абдель Фаттах аль-Бурхан может заблокировать любое вмешательство из Аддис-Абебы. Межправительственный орган по вопросам развития (МОВР), региональная организация Африканского Рога, 16 апреля назначил трех президентов, чтобы попытаться провести переговоры о прекращении огня,  но Сиальва Киир из Южного Судана, Уильям Руто из Кении и Исмаил Омар Гелле из Джибути пока были вынуждены отложить свою поездку в Хартум из-за отсутствия согласия по вопросам обеспечения их безопасности  со стороны суданских противостоящих друг другу сил. Тем не менее, в какой-то момент рассматривался вариант поездки в Порт-Судан, который меньше пострадал от боевых действий, или в Донголу, который находится на пути в Египет. Пока в штаб-квартире АС нет никакого оптимизма как по вопросу установления перемирия, так и по вопросу начала гуманитарной интервенции. АС через председателя Комиссии Муссу Факи Махамата, начальника штаба Мухаммеда эль-Хасана Лабата, внимательно следит за ситуацией в Судане. Они опасаются, что тупиковая ситуация в конфликте и создание фракций внутри двух лагерей еще больше осложнят попытки посредничества. Панафриканский орган также обеспокоен ситуацией в Дарфуре  и опасается, что «Исламское государство» (ИГ, запрещено в России) попытается воспользоваться хаосом, чтобы утвердиться в этом  регионе.

Также в АС серьезно обеспокоены растущим риском дестабилизации ситуации в соседних с Суданом Чаде, ЦАР и Южном Судане.  Чад имеет протяженную границу с Суданом протяженностью 1300 км. Граничащие с Дарфуром на западе Судана восточные регионы Чада и северо-восток ЦАР сильно пострадали от боевых действий, которые начались в этом регионе примерно в 2003 году. В Чаде ополченцы «Джанджавид» убили несколько сотен человек в провинциях Вади-Фира, Уаддай и Сила. В ЦАР такие убийства произошли в префектурах Вакага и Верхнее Котто Обе страны принимали у себя суданских беженцев. Чад, ЦАР и Судан объединяет группа племен, передвижение которых никогда не ограничивалось государственными границами. К ним относятся раунга, различные арабские племена, загава, тама и массалит. В прошлых столкновениях они были мобилизованы многочисленными повстанцами и другими ополченцами, независимо от их формального гражданства. Формирования «Джанджавид» во всех трех странах мобилизовали главным образом арабские общины. Повстанческие группировки в Дарфуре, такие как Движение за справедливость и равенство Халиля Ибрагима, состояли преимущественно из загава. Исламская группа  «Селека» в ЦАР также мобилизовала такие арабские группы, как раунга. Некоторые государства использовали ополченцев и оружие в этих пограничных районах, чтобы усилить нестабильность у своих соседей. При Идриссе Деби Итно и Омаре аль-Башире Чад и Судан поддерживали усилия по дестабилизации в обеих странах с использованием именно фактора загава. Позже, правда, эти разногласия были фактически нивелированы на фоне улучшения отношений между Хартумом и Нджаменой, но основные конфликты в Дарфуре за последние два десятилетия приобрели четко региональный и племенной характер. Это делает нынешний кризис в  Судане тревожным звонком для Чада и ЦАР, которые сами находятся в нестабильной политической ситуации и ситуации в области безопасности. Чад переживает спорный переходный период, при этом риски для безопасности все еще велики в некоторых частях страны, включая восток. ЦАР все еще пытается установить контроль над всей своей территорией, несмотря на военную поддержку со стороны Руанды и частной российской компании «Вагнер». Например, префектура Вакага является постоянным местом нападений повстанческих групп, которыми руководят Нуреддин Адам и Али Дарасса. Из-за этих восстаний Судан закрыл свою границу с ЦАР ранее в этом году. В текущем конфликте в Судане члены общин, принадлежащие к определенным племенам и этническим группам, могут усугубить уязвимость стран на западе. Действительно, RSF Хемити является по сути арабской организацией.  В свою очередь аль-Бурхан ранее вступил в союз с бывшими лидерами части ополченцев загава в Дарфуре, в частности Сулиманом Аркуа Миннави, нынешним губернатором Дарфура. Таким образом, аль-Бурхан заключил альянс с теми загава, которые  находятся в ссоре с Хемити. Принцип хорошо известен: друг вашего врага может легко стать вашим врагом. То, как эти трансграничные сообщества будут позиционировать себя в этой войне, будет иметь важное значение не только для Судана, но и его соседей. В Чаде, например, последние два года власть находится в руках сына Деби, после трех десятилетий пребывания его отца на посту президента. Правящая семья принадлежит к этнической группе загава, в то время как несколько высокопоставленных членов переходного правительства Чада принадлежат к другим арабским племенам. В ЦАР некоторые повстанцы, которые в настоящее время находятся на севере страны, также принадлежат к арабской общине. Несмотря на их нейтральную позицию, обе страны могут оказаться втянутыми в суданский конфликт из-за такой динамики трансграничного сообщества. Чад направил дополнительные войска к своей границе с Суданом и закрыл ее в начале столкновений. Граница с ЦАР остается открытой. Обе страны также уже начали испытывать приток беженце. В Чаде зарегистрировано от 10 000 до 20 000 беженцев в Куфруне; и 320 суданских военных, спасающихся от боевых действий. В середине апреля Организация Объединенных Наций предупредила, что с мая она не сможет прокормить 600 000 беженцев в Чаде, если не получит экстренное международное финансирование. В ЦАР пограничный город Ам-Дафок на севере страны уже принял более 6 240 суданских беженцев с начала конфликта. Экономические последствия войны в Судане также почувствуют его западные соседи. Хотя экспорт и импорт товаров Чада и ЦАР зависят главным образом от Камеруна, восточные провинции Чада и северо-восточные префектуры ЦАР торгуют в основном с Суданом. В населенных пунктах Вакага цены на основные продукты питания уже кратно выросли с начала боевых действий. Гуманитарные учреждения во всех трех странах нуждаются в финансовой поддержке, чтобы справиться с новыми беженцами, что накладывает новые финансовые издержки на Африканское гуманитарное агентство Африканского союза.

Конфликт в Судане также  вызвал опасения в АС по поводу возможности начала полномасштабной гражданской войны, которая может затронуть соседний Южный Судан. Одной из основных проблем для Южного Судана является потенциальное экономическое воздействие затяжного конфликта на севере. Судан экспортирует сырую нефть, добываемую в Южном Судане. Любое нарушение этого торгового соглашения может привести к экономической нестабильности, которая уже серьезно пострадала от последствий недавних восстаний племен в Восточном Судане. На прошлой неделе цена на экспортную нефть Южного Судана упала со 100 долларов за баррель до 70 долларов. Майкл Макуэи, министр информации страны, обвинил нефтяные компании в использовании кризиса для снижения цен, а эксперты говорят, что ситуация в Судане может иметь долгосрочные последствия для нефтяной промышленности Южного Судана. «Ситуация вызывает тревогу, поскольку любое вторжение из Судана станет для нас здесь очень большой проблемой, и именно поэтому президент Сальва Киир призывает к прекращению огня, чтобы в Судане воцарилась нормальная обстановка. Южный Судан очень обеспокоен ситуацией в Судане, особенно учитывая нашу общую границу и исторические связи. Любая эскалация конфликта в Судане может иметь серьезные последствия для нашей страны», — заявил исполняющий обязанности министра иностранных дел Денг Дау Денг Малек.  Южный Судан провозгласил независимость 9 июля 2011 года, разделив крупнейшую страну Африки на две части. После отделения Южного Судана конфликт возобновился в горах Нуба и штате Голубой Нил, в районах, удерживаемых бывшими партизанами, которые теперь называются СНОД-Север. Присутствие этих бывших южносуданских повстанцев вблизи общей границы осложняет нынешний кризис, поскольку их легко можно втянуть в конфликт. Манассия Зиндо, южносуданский независимый аналитик и бывший делегат мирного процесса в Южном Судане, говорит, что участие этих лидеров повстанцев может иметь катастрофические последствия для безопасности Южного Судана: «Малик Агар является лидером СНОД-Север. Он из штата Голубой Нил недалеко от гор Нуба в Судане и был частью Южного Судана во время освободительной борьбы. После отделения Южного Судана из-за делимитации границы он оказался в Судане и сейчас является частью суверенного правительства в Хартуме. Если он примет чью-либо сторону в текущем конфликте в Судане, это может перекинуться на Южный Судан из-за его связей с Южным Суданом». Генерал Саймон Гатвеч Дуал и генерал Джонсон Олони, два бывших южносуданских военных чиновника, которые перешли на сторону различных группировок, также базируются недалеко от суданской границы. Они являются лидерами СНОД-ИО Китгванг, фракции, которая откололась от СНОД-ИО Риека Машара, и их участие в конфликте автоматически дестабилизирует ситуацию в этой регионе.  Правительство Южного Судана в настоящее время находится в состоянии повышенной готовности и призвало граждан, проживающих вблизи границы, проявлять бдительность и сообщать о любых подозрительных действиях.  ООН и другие международные организации также выразили обеспокоенность ситуацией в Судане и ее потенциальным воздействием на Южный Судан. Агентство ООН по делам беженцев, УВКБ ООН, заявляет, что конфликт в Судане уже вынудил тысячи людей бежать в Южный Судан, усугубляя и без того тяжелую гуманитарную ситуацию. По данным УВКБ ООН, в настоящее время в Судане насчитывается более 800 000 южносуданских беженцев, четверть из которых находятся в Хартуме и непосредственно пострадали от боевых действий. Египет заявил на прошлой неделе, что по меньшей мере 14 000 суданских беженцев пересекли его границу с начала боевых действий, а также 2000 человек из 50 других стран. По данным ООН, по меньшей мере 20 000 человек бежали в Чад, 4000 — в Южный Судан, 3500 — в Эфиопию и 3000 — в Центральноафриканскую Республику, которая предупреждает, что в случае продолжения боевых действий могут бежать до 270 000 человек. Гэвин Келлехер, гуманитарный аналитик Норвежского совета по делам беженцев в Южном Судане, сказал, что страна плохо подготовлена к ожидаемому притоку беженцев с севера: «Число вновь прибывших все еще неясно, но, скорее всего, они продолжат увеличиваться в ближайшие недели, и действительно важно, чтобы мы сейчас запустили механизмы эффективного гуманитарного реагирования. Около 75% населения Южного Судана уже нуждаются в гуманитарной помощи, и большая часть страны испытывает чрезвычайную или критическую нехватку продовольствия».